Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Notch4P31695 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Notch4P31695 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Notch4P31695 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Notch4P31695 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Notch4P31695 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Notch4P31695 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms