Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxa2P31245 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms