Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnd1P30999 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms