Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms