Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkcdP28867 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkcdP28867 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkcdP28867 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkcdP28867 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkcdP28867 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkcdP28867 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkcdP28867 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkcdP28867 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkcdP28867 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkcdP28867 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkcdP28867 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PrkcdP28867 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PrkcdP28867 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PrkcdP28867 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrkcdP28867 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms