Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PtprmP28828 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprmP28828 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprmP28828 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprmP28828 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtprmP28828 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtprmP28828 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtprmP28828 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprmP28828 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtprmP28828 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtprmP28828 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PtprmP28828 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
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