Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms