Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dusp1P28563 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dusp1P28563 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms