Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apex1P28352 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apex1P28352 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apex1P28352 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apex1P28352 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apex1P28352 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Apex1P28352 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apex1P28352 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apex1P28352 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Apex1P28352 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Apex1P28352 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apex1P28352 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apex1P28352 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apex1P28352 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apex1P28352 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apex1P28352 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apex1P28352 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apex1P28352 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apex1P28352 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apex1P28352 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apex1P28352 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apex1P28352 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Apex1P28352 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apex1P28352 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apex1P28352 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apex1P28352 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apex1P28352 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apex1P28352 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apex1P28352 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apex1P28352 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apex1P28352 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apex1P28352 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apex1P28352 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apex1P28352 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apex1P28352 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apex1P28352 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apex1P28352 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apex1P28352 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms