Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb1P28230 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms