Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PdgfraP26618 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PdgfraP26618 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PdgfraP26618 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PdgfraP26618 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms