Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gria1P23818 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gria1P23818 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gria1P23818 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gria1P23818 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gria1P23818 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gria1P23818 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gria1P23818 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gria1P23818 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms