Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Ctcflos-203ENSMUST00000144256 1237 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxd11P23813 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Gm29436-202ENSMUST00000189054 1172 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms