Protein–RNA interactions for Protein: P23798

Pcgf2, Polycomb group RING finger protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf2P23798 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcgf2P23798 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcgf2P23798 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcgf2P23798 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcgf2P23798 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcgf2P23798 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms