Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clk1P22518 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clk1P22518 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clk1P22518 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Clk1P22518 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Clk1P22518 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clk1P22518 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clk1P22518 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Clk1P22518 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clk1P22518 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clk1P22518 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clk1P22518 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clk1P22518 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms