Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PdgfaP20033 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfaP20033 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfaP20033 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfaP20033 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfaP20033 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfaP20033 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfaP20033 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfaP20033 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms