Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ms4a1P19437 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ms4a1P19437 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ms4a1P19437 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ms4a1P19437 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ms4a1P19437 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ms4a1P19437 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ms4a1P19437 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ms4a1P19437 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ms4a1P19437 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ms4a1P19437 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms