Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifrd1P19182 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifrd1P19182 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms