Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18532 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18532 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18532 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P18532 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P18532 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18532 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18532 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18532 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18532 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18532 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18532 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18532 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18532 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18532 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18532 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18532 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18532 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18532 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18532 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18532 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18532 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18532 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18532 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18532 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18532 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18532 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18532 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18532 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18532 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18532 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18532 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18532 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18532 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18532 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P18532 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18532 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18532 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P18532 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18532 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18532 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18532 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18532 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18532 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P18532 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P18532 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P18532 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18532 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18532 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18532 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18532 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18532 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18532 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18532 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18532 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18532 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18532 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18532 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18532 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18532 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18532 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18532 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18532 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18532 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18532 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18532 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18532 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P18532 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P18532 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18532 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P18532 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18532 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18532 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18532 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18532 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18532 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18532 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P18532 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18532 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18532 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18532 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18532 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18532 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18532 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P18532 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18532 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18532 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18532 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18532 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18532 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18532 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18532 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18532 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18532 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18532 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18532 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18532 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18532 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18532 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18532 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms