Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18529 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18529 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18529 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18529 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18529 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P18529 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18529 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18529 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18529 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18529 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18529 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18529 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18529 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18529 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P18529 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18529 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18529 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18529 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18529 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18529 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18529 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18529 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18529 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18529 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18529 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18529 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18529 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18529 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18529 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18529 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18529 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18529 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18529 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18529 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P18529 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P18529 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
P18529 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18529 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18529 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18529 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18529 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18529 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18529 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18529 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18529 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18529 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18529 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18529 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18529 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18529 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18529 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18529 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18529 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P18529 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18529 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18529 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18529 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18529 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18529 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18529 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18529 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P18529 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18529 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P18529 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P18529 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P18529 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P18529 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P18529 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18529 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18529 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18529 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18529 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18529 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18529 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P18529 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18529 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18529 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18529 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18529 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P18529 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P18529 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18529 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18529 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18529 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18529 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18529 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18529 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18529 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18529 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18529 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18529 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18529 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18529 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18529 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18529 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18529 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18529 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18529 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18529 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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