Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsdP18242 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsdP18242 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsdP18242 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsdP18242 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsdP18242 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsdP18242 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsdP18242 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsdP18242 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsdP18242 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsdP18242 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsdP18242 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsdP18242 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsdP18242 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsdP18242 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsdP18242 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsdP18242 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsdP18242 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsdP18242 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsdP18242 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsdP18242 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsdP18242 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsdP18242 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsdP18242 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsdP18242 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsdP18242 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsdP18242 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsdP18242 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtsdP18242 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtsdP18242 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtsdP18242 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtsdP18242 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtsdP18242 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CtsdP18242 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtsdP18242 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsdP18242 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsdP18242 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsdP18242 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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