Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PcnaP17918 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PcnaP17918 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PcnaP17918 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PcnaP17918 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PcnaP17918 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PcnaP17918 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PcnaP17918 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PcnaP17918 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PcnaP17918 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PcnaP17918 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PcnaP17918 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms