Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou4f1P17208 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 596.5 ms