Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sptan1P16546 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms