Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms