Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rag1P15919 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rag1P15919 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rag1P15919 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rag1P15919 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rag1P15919 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rag1P15919 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rag1P15919 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rag1P15919 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms