Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme1P15532 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme1P15532 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme1P15532 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme1P15532 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme1P15532 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme1P15532 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme1P15532 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme1P15532 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme1P15532 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme1P15532 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme1P15532 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme1P15532 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme1P15532 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme1P15532 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme1P15532 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme1P15532 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme1P15532 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme1P15532 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme1P15532 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme1P15532 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme1P15532 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme1P15532 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme1P15532 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme1P15532 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme1P15532 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme1P15532 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme1P15532 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms