Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Dnmt1P13864 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms