Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calb1P12658 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Calb1P12658 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Calb1P12658 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calb1P12658 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Calb1P12658 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Calb1P12658 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Calb1P12658 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calb1P12658 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Calb1P12658 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms