Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DmdP11531 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DmdP11531 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DmdP11531 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DmdP11531 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DmdP11531 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DmdP11531 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DmdP11531 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DmdP11531 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DmdP11531 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DmdP11531 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DmdP11531 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DmdP11531 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DmdP11531 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DmdP11531 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DmdP11531 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DmdP11531 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DmdP11531 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DmdP11531 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DmdP11531 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DmdP11531 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DmdP11531 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DmdP11531 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DmdP11531 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DmdP11531 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DmdP11531 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DmdP11531 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DmdP11531 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DmdP11531 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DmdP11531 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DmdP11531 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DmdP11531 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DmdP11531 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DmdP11531 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DmdP11531 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DmdP11531 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DmdP11531 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DmdP11531 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DmdP11531 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DmdP11531 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DmdP11531 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DmdP11531 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DmdP11531 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DmdP11531 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DmdP11531 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DmdP11531 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DmdP11531 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DmdP11531 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DmdP11531 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DmdP11531 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DmdP11531 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DmdP11531 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DmdP11531 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DmdP11531 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DmdP11531 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DmdP11531 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DmdP11531 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DmdP11531 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DmdP11531 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DmdP11531 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DmdP11531 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DmdP11531 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DmdP11531 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DmdP11531 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DmdP11531 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DmdP11531 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DmdP11531 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DmdP11531 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DmdP11531 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DmdP11531 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DmdP11531 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DmdP11531 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DmdP11531 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DmdP11531 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DmdP11531 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DmdP11531 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DmdP11531 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DmdP11531 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DmdP11531 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DmdP11531 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DmdP11531 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DmdP11531 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DmdP11531 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DmdP11531 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DmdP11531 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DmdP11531 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DmdP11531 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DmdP11531 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DmdP11531 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DmdP11531 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DmdP11531 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DmdP11531 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DmdP11531 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DmdP11531 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DmdP11531 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DmdP11531 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DmdP11531 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DmdP11531 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DmdP11531 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DmdP11531 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms