Protein–RNA interactions for Protein: P11087

Col1a1, Collagen alpha-1(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a1P11087 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col1a1P11087 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms