Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms