Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ly6c1P0CW02 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms