Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UbbP0CG49 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms