Protein–RNA interactions for Protein: P0C7L0

Wipf3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wipf3P0C7L0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Wipf3P0C7L0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wipf3P0C7L0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms