Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxc9P09633 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc9P09633 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms