Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax1P09084 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax1P09084 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax1P09084 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax1P09084 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax1P09084 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax1P09084 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax1P09084 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax1P09084 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax1P09084 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.4 ms