Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NeflP08551 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NeflP08551 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NeflP08551 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NeflP08551 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NeflP08551 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NeflP08551 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NeflP08551 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NeflP08551 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NeflP08551 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NeflP08551 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NeflP08551 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NeflP08551 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NeflP08551 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NeflP08551 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NeflP08551 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NeflP08551 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NeflP08551 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NeflP08551 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NeflP08551 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NeflP08551 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NeflP08551 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NeflP08551 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NeflP08551 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NeflP08551 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NeflP08551 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NeflP08551 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NeflP08551 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NeflP08551 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NeflP08551 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NeflP08551 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NeflP08551 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NeflP08551 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NeflP08551 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NeflP08551 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NeflP08551 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NeflP08551 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NeflP08551 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NeflP08551 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NeflP08551 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NeflP08551 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NeflP08551 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NeflP08551 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NeflP08551 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NeflP08551 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NeflP08551 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NeflP08551 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NeflP08551 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NeflP08551 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NeflP08551 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NeflP08551 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NeflP08551 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NeflP08551 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NeflP08551 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NeflP08551 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NeflP08551 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NeflP08551 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NeflP08551 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NeflP08551 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NeflP08551 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NeflP08551 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NeflP08551 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NeflP08551 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NeflP08551 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NeflP08551 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NeflP08551 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NeflP08551 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NeflP08551 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NeflP08551 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NeflP08551 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NeflP08551 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NeflP08551 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NeflP08551 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NeflP08551 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NeflP08551 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NeflP08551 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NeflP08551 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NeflP08551 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NeflP08551 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NeflP08551 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NeflP08551 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NeflP08551 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NeflP08551 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NeflP08551 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NeflP08551 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NeflP08551 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NeflP08551 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NeflP08551 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NeflP08551 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NeflP08551 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NeflP08551 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NeflP08551 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NeflP08551 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NeflP08551 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NeflP08551 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NeflP08551 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NeflP08551 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NeflP08551 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NeflP08551 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NeflP08551 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms