Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P04213 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P04213 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P04213 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P04213 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P04213 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P04213 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P04213 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P04213 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P04213 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P04213 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P04213 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P04213 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P04213 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P04213 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P04213 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04213 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04213 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04213 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04213 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04213 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04213 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04213 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04213 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04213 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04213 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04213 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04213 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04213 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04213 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04213 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04213 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04213 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04213 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04213 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04213 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04213 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04213 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04213 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04213 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04213 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04213 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04213 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04213 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04213 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04213 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04213 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04213 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04213 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P04213 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04213 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04213 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04213 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04213 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04213 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04213 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04213 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04213 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04213 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P04213 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04213 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04213 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04213 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P04213 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P04213 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04213 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04213 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04213 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04213 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04213 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04213 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04213 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04213 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P04213 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P04213 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P04213 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P04213 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P04213 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P04213 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P04213 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P04213 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P04213 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P04213 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P04213 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P04213 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P04213 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P04213 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P04213 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P04213 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P04213 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P04213 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P04213 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P04213 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P04213 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P04213 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P04213 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P04213 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P04213 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P04213 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P04213 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms