Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms