Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-AaP01910 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-AaP01910 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-AaP01910 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-AaP01910 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-AaP01910 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-AaP01910 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-AaP01910 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-AaP01910 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-AaP01910 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-AaP01910 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-AaP01910 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-AaP01910 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-AaP01910 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-AaP01910 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-AaP01910 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-AaP01910 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-AaP01910 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-AaP01910 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-AaP01910 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-AaP01910 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-AaP01910 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-AaP01910 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
H2-AaP01910 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms