Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P01740 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P01740 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P01740 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01740 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01740 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01740 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01740 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01740 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01740 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01740 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01740 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01740 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01740 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01740 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01740 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01740 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01740 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01740 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01740 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01740 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01740 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01740 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01740 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01740 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01740 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01740 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01740 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01740 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01740 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01740 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01740 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01740 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01740 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01740 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01740 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01740 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P01740 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P01740 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P01740 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P01740 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P01740 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P01740 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01740 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01740 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
P01740 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01740 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01740 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01740 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01740 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01740 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01740 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01740 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01740 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01740 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01740 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01740 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01740 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01740 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01740 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01740 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01740 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01740 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01740 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01740 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01740 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01740 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
P01740 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01740 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01740 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01740 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01740 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01740 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01740 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01740 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01740 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
P01740 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01740 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01740 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01740 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
P01740 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01740 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01740 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01740 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01740 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01740 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01740 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01740 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01740 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01740 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01740 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01740 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01740 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01740 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01740 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01740 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01740 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01740 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01740 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01740 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms