Protein–RNA interactions for Protein: P01630

Ig kappa chain V-II region 7S34.1, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01630 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01630 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01630 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01630 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01630 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01630 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01630 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01630 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01630 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01630 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01630 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01630 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01630 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01630 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01630 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01630 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01630 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01630 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01630 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01630 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01630 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01630 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01630 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01630 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01630 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01630 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01630 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01630 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01630 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01630 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01630 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01630 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01630 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01630 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01630 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01630 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01630 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01630 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01630 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01630 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01630 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01630 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01630 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01630 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01630 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01630 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01630 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01630 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01630 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01630 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01630 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01630 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01630 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01630 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01630 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01630 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01630 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01630 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01630 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01630 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01630 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01630 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01630 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01630 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01630 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01630 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01630 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01630 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01630 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01630 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01630 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01630 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01630 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01630 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01630 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01630 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01630 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01630 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01630 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01630 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01630 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01630 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01630 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01630 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01630 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01630 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01630 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01630 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01630 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01630 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01630 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01630 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01630 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01630 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01630 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01630 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01630 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01630 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01630 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01630 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms