Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Setdb1O88974 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms