Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cops6O88545 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cops6O88545 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cops6O88545 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cops6O88545 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cops6O88545 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cops6O88545 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cops6O88545 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cops6O88545 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cops6O88545 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms