Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AurkcO88445 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AurkcO88445 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AurkcO88445 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AurkcO88445 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AurkcO88445 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AurkcO88445 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AurkcO88445 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AurkcO88445 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AurkcO88445 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AurkcO88445 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AurkcO88445 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AurkcO88445 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms