Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vti1bO88384 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms