Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nid2O88322 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nid2O88322 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nid2O88322 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Nid2O88322 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Nid2O88322 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nid2O88322 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nid2O88322 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nid2O88322 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nid2O88322 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nid2O88322 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nid2O88322 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms