Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm10509O88255 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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