Protein–RNA interactions for Protein: O70546

Kdm6a, Lysine-specific demethylase 6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6aO70546 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm6aO70546 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm6aO70546 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms